De hypothalamus is bij de hond een zeer belangrijk regelcentrum voor het constant houden van het inwendige milieu. Het regelt alle autonome en hormonale processen in het lichaam, zoals de regeling van de lichaamstemperatuur, de koolhydraathuishouding, de water- en zouthuishouding en de groei en voortplanting.

Ook op gedrag heeft de hypothalamus een regelende invloed. Bij de drie kerngedragingen van een hond is het vooral aanwezig. Deze drie kerngedragingen zijn:

• Vlucht- en afweergedrag
• Voedingsgedrag
• Voortplantingsgedrag

De hypothalamus bestaat uit zenuwcellen en is een deel van de tussenhersenen. Hij ontvang zijn informatie van de hogere gebieden, zoals de epifyse (ook een onderdeel van de hersenen), en via zijn eigen celreceptoren. Deze celreceptoren reageren op hormonen die geproduceerd worden door andere endocriene klieren. De hypothalamus staat op twee manieren in verbinding met de hypofyse. Als eerste via zijn axonen (dit zijn uitlopers van een zenuwcel die elektrische impulsen geleidt) en ten tweede via een poortadersysteem.
Deze twee verbindingen samen heten de hypothalamo-hypofysaire as.